焚燒秸稈主要有以下幾點危害：
①污染空氣環(huán)境，危害人體健康。有數(shù)據(jù)表明，焚燒秸稈時，大氣中二氧化硫、二氧化氮、可吸入顆粒物三項污染指數(shù)達到高峰值，其中二氧化硫的濃度比平時高出1倍，二氧化氮、可吸入顆粒物的濃度比平時高出3倍，相當(dāng)于日均濃度的五級水平。當(dāng)可吸入顆粒物濃度達到一定程度時，對人的眼睛、鼻子和咽喉含有黏膜的部分刺激較大，輕則造成咳嗽、胸悶、流淚，嚴(yán)重時可能導(dǎo)致支氣管炎發(fā)生。
②引發(fā)火災(zāi)，威脅群眾的生命財產(chǎn)安全。秸稈焚燒，極易引燃周圍的易燃物，尤其是在村莊附近，一旦引發(fā)火災(zāi)，后果將不堪設(shè)想。
③引發(fā)交通事故，影響道路交通和航空安全。露天焚燒秸稈帶來的一個最突出的問題就是焚燒過程中產(chǎn)生滾滾濃煙，直接影響民航、鐵路、高速公路的正常運營，對交通安全構(gòu)成潛在威脅。機場每逢農(nóng)作物收割季節(jié)都深受秸稈露天焚燒的危害，有時機場能見度低于400米，嚴(yán)重影響機場航班正常起飛和降落，航空公司及旅客對此反映強烈，一旦導(dǎo)致事故，將造成極為不良的社會影響，農(nóng)作物秸稈可以經(jīng)過秸稈顆粒機、秸稈壓塊機壓制成生物質(zhì)成型顆粒燃料，這樣不僅可以做到農(nóng)作物秸稈的綜合利用，而且還可以使老百姓增加收入。
④破壞土壤結(jié)構(gòu)，造成耕地質(zhì)量下降。影響作物對土壤養(yǎng)分的充分吸收，直接影響農(nóng)田作物的產(chǎn)量和質(zhì)量，影響農(nóng)業(yè)收益。在農(nóng)田焚燒稻草稈焚燒秸稈使地面溫度急劇升高，能直接燒死、燙死土壤中的有益微生物，會使土壤的自然肥力和保水性能大大下降，土壤水分損失65％—80％，板結(jié)不耐旱。
⑤焚燒秸稈所形成的滾滾煙霧、片片焦土，對一個地區(qū)的環(huán)境形象是最大的破壞。